Пущинская средняя общеобразовательная школа № 2 (ранее - Пущинская средняя общеобразовательная школа Российской академии образования, Пущинская экспериментальная средняя школа) была открыта 1 сентября 1970 года в г. Пущино Московской области.

Школа изначально является экспериментальным образовательным учреждением, на базе которого проводились практико-ориентированные исследования и опытно-экспериментальная работа Научно-исследовательского института содержания и методов обучения Академии педагогических наук СССР. Начиная с 1971 года, основным направлением работы Научно-исследовательского института содержания и методов обучения Академии педагогических наук СССР на базе школы являлся комплексный эксперимент по проведению систематического обучения в школе детей с 6-летнего возраста с началом изучения иностранного языка с 1 класса.

В течение трех лет научные сотрудники сектора начального обучения и лабораторий при Пущинской школе института содержания и методов обучения НИИ СиМО АПН СССР совместно с администрацией и учителями школы проводили исследования по определению наиболее рационального режима учебного дня и учебного плана, соответствующих возрастным особенностям учащихся и обеспечивающих полноценное физическое развитие детей. Определялись наиболее эффективные формы работы с детьми, начавшими обучение с шести лет, отрабатывались методические приемы для успешного формирования учебной деятельности учащихся на основе содержания существующей трехлетней программы начальной школы.

Экспериментальное преподавание было поручено учителям начальных классов. Руководство осуществляли научные сотрудники научно-исследовательского института содержания и методов обучения Академии педагогических наук СССР. Эксперимент возглавил директор института член-корреспондент Академии педагогических наук СССР М.П.Кашин.

Для организации экспериментального преподавания и систематического наблюдения за ходом эксперимента и экспериментального исследования в процессе обучения в г. Пущино непосредственно при школе была организована специальная лаборатория института содержания и методов обучения НИИ СиМО (заведующая лабораторией кандидат педагогических наук Татьяна Петровна Славгородская). Т.П. Славгородская одновременно являлась директором школы до 1976 года. На базе школы проводились исследования по разработке новых курсов русского языка, математики, биологии, истории, физики, химии, английского языка.

С 1980 года центральным направлением в работе педагогического коллектива является экологическое образование и воспитание учащихся. Под руководством академика Академии педагогических наук СССР И.Д.Зверева на базе школы в рамках повышения квалификации учителей проводился двухгодичный творческий семинар "Проблемы теории и практики экологического образования школьников". Сформировалась группа учителей-исследователей и ученых консультантов, сотрудников лаборатории экологического образования научно-исследовательского института содержания и методов обучения (И.Т.Суравегина, А.Н.Захлебный, В.М.Сенкевич, Н.Н.Петрова, Т.В.Кучер, Л.П.Симонова-Салеева).

В практику работы школы вошли научно-практические конференции школьников по экологии, конкурсы творческих работ учащихся (экологических рисунков и плакатов, защита рефератов), полевые экологические практикумы, комплексные экологические экскурсии по изучению экологии города. Была проложена экологическая тропа с целью наблюдений взаимодействий человека с природой в микрорайоне города. В 1982 году на базе Пущинской экспериментальной средней школы был проведен симпозиум стран СЭВ и Финляндии по теме "Экологическое образование в системе работы школьного коллектива" (руководитель вице-президент Академии педагогических наук СССР И.Д.Зверев). В настоящее время сформировалась модель экологического образования учащихся Пущинской экспериментальной средней школы.

В последующее время опытно-экспериментальная работа получила дальнейшее развитие. Это: